Анализ данных NGS: практика для начинающих
Подробнее
Что нужно для старта
- 1) Общие теоретические знания по Секвенированию ДНК;
- 2) Знания Linux — уровень пользователя;
- 3) Чтение на английском языке.
Чему вы научитесь
- Лабораторный практикум для начинающих: Это небольшое исследование от сырых данных до сборки генома. Мы покажем ГДЕ и КАК можно взять данные и ЧТО с ними в принципе можно сделать полезного, используя доступный любому биологу обычный компьютер.
Для кого этот курс
- Биологи и все-все.
Программа курса
- Что это за практика?
- Что нам понадобится? Системные требования.
- Настройка рабочего пространства - что именно?
- Откуда и какие данные возьмем?
- Что со всем этим можно делать?
- Оценка качества - FastQC
- Пробоподготовка - Trimmomatic
- Проверка контаминации - таксономическая проверка
- Выравнивание и визуализация
- Поиск вариантов и визуализация
- Аннотация вариантов
- От ридов к контигам
- От контигов к консенсусу
- Pipeline - блок-схема.
- Итоговый тест
- Послесловие
- Выбор последовательности
- Множественное выравнивание
- Построение филогенетического дерева
01Введение
- Что это за практика?
- Что нам понадобится? Системные требования.
- Настройка рабочего пространства - что именно?
- Откуда и какие данные возьмем?
- Что со всем этим можно делать?
02Входной контроль качества
- Оценка качества - FastQC
- Пробоподготовка - Trimmomatic
- Проверка контаминации - таксономическая проверка
03Выравнивание прочтений и поиск вариантов
- Выравнивание и визуализация
- Поиск вариантов и визуализация
- Аннотация вариантов
04Сборка генома
- От ридов к контигам
- От контигов к консенсусу
05Заключение
- Pipeline - блок-схема.
- Итоговый тест
- Послесловие
06Филогенетика - поиск родственников
- Выбор последовательности
- Множественное выравнивание
- Построение филогенетического дерева
Сертификат Stepik
Отзывы о курсе
Оставьте отзыв
Расскажите о качестве обучения, поддержке и результате. Это поможет другим выбрать организацию осознанно.
Оставьте заявку
Консультант ответит на вопросы о курсе «Анализ данных NGS: практика для начинающих» и поможет разобраться в деталях обучения.
Нажимая кнопку, вы даете согласие на обработку персональных данных
Информация обновлена 29 июля 2026 г.

Stepik 




















