Мы используем cookie для стабильной работы сервиса. Подробнее

Bioinformatics I: Finding Hidden Messages in DNA

ФорматОнлайн
Объём2 занятий
О курсе

Подробнее

This course is the first and free part of the Bioinformatics Specialization.Please join us on the frontier of bioinformatics to look for hidden messages in DNA without ever needing to put on a lab coat. In the first half of the course, we investigate DNA replication, and ask the question, where in the genome does DNA replication begin? We will see that we can answer this question for many bacteria using only some straightforward algorithms to look for hidden messages in the genome.In the second half of the course, we examine a different biological question, when we ask which DNA patterns play the role of molecular clocks. The cells in your body manage to maintain a circadian rhythm, but how is this achieved on the level of DNA? Once again, we will see that by knowing which hidden messages to look for, we can start to understand the amazingly complex language of DNA. Perhaps surprisingly, we will apply randomized algorithms, which roll dice and flip coins in order to solve problems. Finally, you will get your hands dirty and apply existing software tools to find recurring biological motifs within genes that are responsible for helping Mycobacterium tuberculosis go "dormant" within a host for many years before causing an active infection
Содержание

Программа курса

2 занятия
№ТемаЧто внутри
01Where in the Genome Does Replication Begin?

- A Journey of a Thousand Miles. . .
- Hidden Messages in the Replication Origin
- Some Hidden Messages are More Surprising than Others
- An Explosion of Hidden Messages
- The Simplest Way to Replicate DNA
- Asymmetry of Replication
- Peculiar Statistics of the Forward and Reverse Half-Strands
- Some Hidden Messages are More Elusive than Others
- A Final Attempt at Finding DnaA Boxes in E. coli
- Epilogue: Complications in ori Predictions
- CS: Generating the Neighborhood of a String
- Detour: Big-O Notation
- Detour: Probabilities of Patterns in a String
- Detour: The Most Beautiful Experiment in Biology
- Detour: Directionality of DNA Strands
- Detour: The Towers of Hanoi
- Detour: The Overlapping Words Paradox

02Which DNA Patterns Play the Role of Molecular Clocks?

- Do We Have a "Clock" Gene?
- Motif Finding Is More Difficult Than You Think
- Scoring Motifs
- From Motif Finding to Finding a Median String
- Greedy Motif Search
- Motif Finding Meets Oliver Cromwell
- Randomized Motif Search
- How Can a Randomized Algorithm Perform So Well?
- Gibbs Sampling
- Gibbs Sampling in Action
- Epilogue: How Does Tuberculosis Hibernate?
- CS: Solving the Median String Problem
- Detour: Gene Expression
- Detour: DNA Arrays
- Detour: Buffon's Needle
- Detour: Complications in Motif Finding
- Detour: Relative entropy

01Where in the Genome Does Replication Begin?

- A Journey of a Thousand Miles. . .
- Hidden Messages in the Replication Origin
- Some Hidden Messages are More Surprising than Others
- An Explosion of Hidden Messages
- The Simplest Way to Replicate DNA
- Asymmetry of Replication
- Peculiar Statistics of the Forward and Reverse Half-Strands
- Some Hidden Messages are More Elusive than Others
- A Final Attempt at Finding DnaA Boxes in E. coli
- Epilogue: Complications in ori Predictions
- CS: Generating the Neighborhood of a String
- Detour: Big-O Notation
- Detour: Probabilities of Patterns in a String
- Detour: The Most Beautiful Experiment in Biology
- Detour: Directionality of DNA Strands
- Detour: The Towers of Hanoi
- Detour: The Overlapping Words Paradox

02Which DNA Patterns Play the Role of Molecular Clocks?

- Do We Have a "Clock" Gene?
- Motif Finding Is More Difficult Than You Think
- Scoring Motifs
- From Motif Finding to Finding a Median String
- Greedy Motif Search
- Motif Finding Meets Oliver Cromwell
- Randomized Motif Search
- How Can a Randomized Algorithm Perform So Well?
- Gibbs Sampling
- Gibbs Sampling in Action
- Epilogue: How Does Tuberculosis Hibernate?
- CS: Solving the Median String Problem
- Detour: Gene Expression
- Detour: DNA Arrays
- Detour: Buffon's Needle
- Detour: Complications in Motif Finding
- Detour: Relative entropy

Организатор

Автор курса

StepikStepik
Stepik — образовательная платформа и конструктор онлайн-курсов. Мы разрабатываем алгоритмы адаптивного обучения, сотрудничаем с авторами MOOC, помогаем в проведении олимпиад и программ переподготовки. Наша цель — сделать образование открытым и удобным. Stepik — широко известная российская образовательная платформа, основанная в 2013 году. На Stepik зарегистрировано более миллиона пользователей из России и стран СНГ. В настоящее время на Stepik представлены несколько тысяч учебных курсов на самые разные темы.
Подробнее об авторе
Мнения учеников

Отзывы о курсе

Оставьте отзыв

Расскажите о качестве обучения, поддержке и результате. Это поможет другим выбрать организацию осознанно.

Напишите ваш коментарий, не менее 30 символов

Нажимая кнопку, вы даете согласие на обработку персональных данных

Оставьте заявку

Консультант ответит на вопросы о курсе «Bioinformatics I: Finding Hidden Messages in DNA» и поможет разобраться в деталях обучения.

Комментарий ...

Нажимая кнопку, вы даете согласие на обработку персональных данных

Информация обновлена 7 сентября 2026 г.

Продолжить выбор

Похожие курсы

Металловедение - курс переподготовки
−17%256 часов
Металловедение - курс переподготовки

Центр ДПО «АПОК» проводит дистанционные курсы переподготовки по металловедению. Обучение у нас позволит специалистам в короткие сроки получить легитимный диплом и освоить професси…

Онлайн16 занятий
Текстовые уроки
39 910 ₽−17%
32 980 ₽Скидка до 26 октября
Начать без затрат

Бесплатные курсы

Вводный курс для биологов. Летняя школа по биоинформатике 2017
Бесплатно
Вводный курс для биологов. Летняя школа по биоинформатике 2017

Летняя школа по биоинформатике 2017Прием заявок открыт до 10 июня.Летняя школа по биоинформатике проводится ежегодно с 2013 года для 100 студентов, начинающих аспирантов и молодых…

Онлайн2 занятий
Бесплатно
Tree-Thinking Challenge
Бесплатно
Tree-Thinking Challenge

This course is the interactive implementation of Tree-Thinking Quizzes, developed by David A. Baum, Stacey DeWitt Smith, and Samuel S. Donovan. Below is a quote from the original…

Онлайн1 занятий
Бесплатно
Структуры данных предметной области
Бесплатно
Структуры данных предметной области

Основные задачи дисциплины: − Дальнейшее развитие и углубление навыков алгоритмизации и программирования при решении прикладных задач предметной области. − Знакомство с реализацие…

Онлайн5 занятий
Бесплатно
IT-сеанс: погружение в мир данных
Бесплатно
IT-сеанс: погружение в мир данных

Презентации спикеров и записи выступлений с Зимней школы по аналитике и Data Science 2025. Приглашаем к просмотру докладов всех, кто хочет разобраться: Зачем переходить в IT? Как…

Онлайн5 занятий
Бесплатно