Stepik Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore
О курсе
Подробнее
Секвенирование 3-го поколения (3rd generation NGS) - методы высокоэффективного секвенирования, позволяющие получать длинные прочтения (от 1 тыс. и до миллионов нуклеотидов). Наш курс посвящен секвенированию при помощи приборов от компании Oxford Nanopore. Вы познакомитесь с теоретическими основами работы этих приборов, получите практические советы по запуску и решению основных проблем в работе, а также ознакомитесь с особенностями биоинформатической обработки длинных прочтений. Данный курс требует понимания основ молекулярной биологии, секвенирования, и биоинформатики, однако не имеет жестких требований по предварительному прохождению других курсов.
Требования
Что нужно для старта
- Данный курс требует понимания основ молекулярной биологии, секвенирования, и биоинформатики, однако не имеет жестких требований по предварительному прохождению других курсов.
Аудитория
Для кого этот курс
- Исследователи, использующие высокоэффективное секвенирование (NGS) в повседневной работе — как молекулярные биологи, так и биоинформатики.
Содержание
4 занятияПрограмма курса
№ТемаЧто внутри
01Знакомство с технологией Oxford Nanopore
- Введение
- Сравнение возможностей секвенирования 2-го и 3-го поколения
- Преимущества и проблемы нанопорного секвенирования
- Краткая история Oxford Nanopore
- Разнообразие приборов от Oxford Nanopore
- Дополнительная информация и ссылки к первому модулю
02Протоколы, используемые Oxford Nanopore
- Основные протоколы секвенирования ДНК: rapid, 1D и 1D^2
- Баркодирование библиотек
- Прямое секвенирование РНК: первый взгляд на РНК без посредников
- Выделение длинной ДНК
- Проверка ячеек, подготовка к секвенированию и секвенирование
- Ссылки ко второму модулю
03Применения нанопорного секвенирования
- Полногеномное секвенирование: соединяй и властвуй
- Секвенирование ампликонов: 16S, 18S, и другие
- Секвенирование кДНК и прямое секвенирование РНК
- Анализ сложных структурных вариантов ДНК
- Ссылки к третьему модулю
04Биоинформатика длинных прочтений
- Определение последовательности из сигнала (Basecalling)
- Выравнивание длинных прочтений
- Гибридная и прямая сборка длинных прочтений
- Полировка геномных сборок
- Анализ данных метагеномного секвенирования
- Обработка результатов секвенирования кДНК и РНК
- Ссылки к четвертому модулю
- Заключение
01Знакомство с технологией Oxford Nanopore
- Введение
- Сравнение возможностей секвенирования 2-го и 3-го поколения
- Преимущества и проблемы нанопорного секвенирования
- Краткая история Oxford Nanopore
- Разнообразие приборов от Oxford Nanopore
- Дополнительная информация и ссылки к первому модулю
02Протоколы, используемые Oxford Nanopore
- Основные протоколы секвенирования ДНК: rapid, 1D и 1D^2
- Баркодирование библиотек
- Прямое секвенирование РНК: первый взгляд на РНК без посредников
- Выделение длинной ДНК
- Проверка ячеек, подготовка к секвенированию и секвенирование
- Ссылки ко второму модулю
03Применения нанопорного секвенирования
- Полногеномное секвенирование: соединяй и властвуй
- Секвенирование ампликонов: 16S, 18S, и другие
- Секвенирование кДНК и прямое секвенирование РНК
- Анализ сложных структурных вариантов ДНК
- Ссылки к третьему модулю
04Биоинформатика длинных прочтений
- Определение последовательности из сигнала (Basecalling)
- Выравнивание длинных прочтений
- Гибридная и прямая сборка длинных прочтений
- Полировка геномных сборок
- Анализ данных метагеномного секвенирования
- Обработка результатов секвенирования кДНК и РНК
- Ссылки к четвертому модулю
- Заключение
Документ после выпуска
по успешному окончанию курса выдается сертификат
Организатор
Автор курса
Мнения учеников
Отзывы о курсе
Оставьте отзыв
Расскажите о качестве обучения, поддержке и результате. Это поможет другим выбрать организацию осознанно.
Оставьте заявку
Консультант ответит на вопросы о курсе «Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore» и поможет разобраться в деталях обучения.
Нажимая кнопку, вы даете согласие на обработку персональных данных
Информация обновлена 14 сентября 2026 г.
Продолжить выбор
Похожие курсы
Начать без затрат
